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研究者詳細情報
研究者 仁井見 英樹
大学 富山大学 医学部医学科
研究室名 富山大学医学部 臨床分子病態検査学講座
専門分野 病態検査学
研究テーマ 我々はバクテリアDNAのコンタミネーションの無い耐熱性DNA合成酵素(eukaryote-made Taq DNA polymerase)の作成に成功した(J Clin Microbiol 2011)この酵素はバクテリアを正確・高感度にPCR検出できるため,感染症起炎菌のPCR検出に有用となる.また, eukaryote-made Taq polymeraseを併用して,melting temperature (Tm) mapping methodを独自開発した.Tm mapping法とは,検出菌からPCR ampliconを作成し,そこから得られた7つのTm値を二次元にmappingした“形"を菌のフィンガープリントとして用いる新たな同定方法であり,迅速かつ低コストの同定を可能とする(Scientific Reports 2015).
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特許

出願番号:2008-501721 / 特開番号:再表2007/097323 / 登録番号:4590573

感染症起因菌の迅速同定方法

【課題】感染症起因菌、とりわけ敗血症の起因菌を迅速に検出・同定し、適切な抗菌薬を選択するシステムを提供すること。

【解決手段】本発明は、リアルタイムPCRなどの遺伝子増幅を行い、遺伝子増幅産物の融解曲線分析により求めた融解温度(Tm値)の組合せ、或いは各Tm値間の差の組合せを解析することにより起因菌の検出・同定を迅速に行う方法である。
具体的には細菌の16SリボソームRNAに1~7つ、真菌の18SリボソームRNAに1~6つ、MRSA特異的なspa遺伝子およびmecA遺伝子に各1つ、計4~16つのプライマーセットを使用してリアルタイムPCRを行い、その増幅物のTm値の組合せ、或いは各Tm値間の差の組合せをデータベースと照合し、敗血症起因菌の同定を行う。
本発明の方法により、感染症起因菌、とりわけ敗血症の起因菌を迅速に検出・同定することができ、敗血症の迅速診断法と敗血症治療におけるEvidence-based Medicineが可能となる。


論文

Melting Temperature Mapping Method: A Novel Method for Rapid Identification of Unknown Pathogenic Microorganisms within Three Hours of Sample Collection

Niimi H, Ueno T, Hayashi S, Abe A, Tsurue T, Mori M, Tabata H, Minami H, Goto M, Akiyama M, Yamamoto Y, Saito S and Kitajima I

Scientific Reports 5 12543 1 - 13 2015年07月


Eukaryote-Made Thermostable DNA Polymerase Enables Rapid PCR-Based Detection of Mycoplasma, Ureaplasma and Other Bacteria in the Amniotic Fluid of Preterm Labor Cases

Ueno T, Niimi H, Yoneda N, Yoneda S, Mori M, Tabata H, Minami H, Saito S, Kitajima I.

PLoS One 10 ( 6 ) e0129032 1 - 17 2015年06月


A Rapid and High-Throughput Quantitation Assay of the Nuclear Factor κB Activity Using Fluorescence Correlation Spectroscopy in the Setting of Clinical Laboratories

Harada K, Mikuni S, Beppu H, Niimi H, Abe S, Hano N, Yamagata K, Kinjo M, Kitajima I

PLOS ONE 8 ( 10 ) 1 - 8 2013年10月


Trend survey of ocular infections with bacteria at Toyama University Hospital over the past six years--from the standpoint of laboratory examination

Kubota T, Hayashi S, Niimi H, Kitajima I

Rinsho byori 60 605 - 611 2012年07月


Establishment of the rapid, hypersensitive testing systems for sepsis/SIRS

Kitajima I, Niimi H

Rinsho byori 60 46 - 51 2012年01月


科研費

蛍光相関分光法による炎症関連転写因子活性定量プロファイル解析の臨床検査への展開

基盤研究(C) 2015-04-01 ~ 2018-03-31


検体中の生菌数を感染症重症度や治療効果の新たな指標とする検査技術の開発

基盤研究(C) 2015-04-01 ~ 2018-03-31


新規高感度迅速起因菌同定法とNF-κB病態解析法を統合した敗血症検査システム構築

萌芽研究 2013-04-01 ~ 2015-03-31


新たなTaq酵素を用いた迅速な感染症起因菌同定ITシステムの臨床応用

基盤研究(C) 2012-04-01 ~ 2015-03-31


迅速・簡便・安価な敗血症起因菌同定ITシステムの構築

基盤研究(C) 2009-04-01 ~ 2012-03-31