特許詳細
出願番号 | 2006-198485 |
登録番号 | 4069208 |
国際特許分類 | G06F 19/00, |
発明名称 | 遺伝子相互作用推定方法、遺伝子相互作用推定プログラム、及び遺伝子相互作用推定装置、並びに、結合サイト推定方法、結合サイト推定プログラム、及び結合サイト推定装置 |
出願人又は権利者 | JAIST |
研究者 | |
研究分野 | 情報・通信創薬 |
用途 | 研究 データ処理 |
要約 課題 | DNAマイクロアレイを用いながらも、高精度に遺伝子相互作用の推定を行うことができる遺伝子相互作用推定方法を提供する。 |
要約 解決手段 | 遺伝子相互作用推定方法は、発現データの相関を利用した第1のフィルタリング処理、結合サイトを推定する全く新規の手法である第2のフィルタリング処理、及び実験操作を加えた遺伝子発現データを利用した第3のフィルタリング処理による3つの独立した推定方法を融合させて行う。第2のフィルタリング処理としては、遺伝子aと、当該遺伝子aと相関係数の絶対値が大きい上位所定個数の遺伝子群Bの各遺伝子bとのペアについて、これらのウィンドウに含まれる近接した開始位置をもつ所定長kの文字列同士の類似度の最大値をその位置の類似度と定義したときの各位置に対する類似度の合計であるウィンドウ類似度を算出する。 |
問い合わせ先 |
JAIST 産学官連携推進センター 0761-51-1070 |
更新日 | 2017/12/01 |